MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis strain F/6-94

Total Repeats: 20540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022118	ATG	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421824
2	NC_022118	GTG	2	6	1342	1347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532421824
3	NC_022118	TCC	2	6	1351	1356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532421824
4	NC_022118	AGC	2	6	1365	1370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421824
5	NC_022118	T	6	6	1384	1389	0 %	100 %	0 %	0 %	532421824
6	NC_022118	AGC	2	6	1392	1397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421824
7	NC_022118	AAG	2	6	1403	1408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421824
8	NC_022118	TAC	2	6	1441	1446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421824
9	NC_022118	GCT	2	6	1451	1456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421824
10	NC_022118	AGTA	2	8	1489	1496	50 %	25 %	25 %	0 %	532421824
11	NC_022118	AAC	2	6	1549	1554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532421824
12	NC_022118	AGA	2	6	1561	1566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421824
13	NC_022118	AGA	2	6	1817	1822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421825
14	NC_022118	ATC	2	6	1824	1829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421825
15	NC_022118	TGC	2	6	1844	1849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421825
16	NC_022118	ATGA	2	8	1893	1900	50 %	25 %	25 %	0 %	532421825
17	NC_022118	GATA	2	8	1931	1938	50 %	25 %	25 %	0 %	532421825
18	NC_022118	CAT	2	6	1968	1973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421825
19	NC_022118	AGA	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421825
20	NC_022118	AAG	2	6	2026	2031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421825
21	NC_022118	GGA	2	6	2061	2066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421825
22	NC_022118	AG	3	6	2153	2158	50 %	0 %	50 %	0 %	532421826
23	NC_022118	ATC	2	6	2190	2195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421826
24	NC_022118	TTTC	2	8	2228	2235	0 %	75 %	0 %	25 %	532421826
25	NC_022118	ATA	2	6	2340	2345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532421826
26	NC_022118	AAC	2	6	2365	2370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532421826
27	NC_022118	GGT	2	6	2419	2424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532421826
28	NC_022118	AAT	2	6	2525	2530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532421826
29	NC_022118	TTC	2	6	2560	2565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421826
30	NC_022118	GCA	2	6	2579	2584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421826
31	NC_022118	GGA	2	6	2627	2632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421826
32	NC_022118	CAG	2	6	2646	2651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421826
33	NC_022118	GTT	2	6	2663	2668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421826
34	NC_022118	GGT	2	6	2755	2760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532421826
35	NC_022118	GA	3	6	2821	2826	50 %	0 %	50 %	0 %	532421826
36	NC_022118	T	6	6	2828	2833	0 %	100 %	0 %	0 %	532421826
37	NC_022118	AAG	2	6	2913	2918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421826
38	NC_022118	ATT	2	6	2975	2980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421826
39	NC_022118	TTG	2	6	3027	3032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421826
40	NC_022118	CATG	2	8	3109	3116	25 %	25 %	25 %	25 %	532421826
41	NC_022118	AAG	2	6	3138	3143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421826
42	NC_022118	AAG	2	6	3153	3158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421826
43	NC_022118	CAG	2	6	3195	3200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421826
44	NC_022118	GCT	2	6	3266	3271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421826
45	NC_022118	TGTGA	2	10	3281	3290	20 %	40 %	40 %	0 %	532421826
46	NC_022118	TTCC	2	8	3414	3421	0 %	50 %	0 %	50 %	532421826
47	NC_022118	AAG	2	6	3432	3437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421826
48	NC_022118	CAG	2	6	3482	3487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421826
49	NC_022118	GGA	2	6	3569	3574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421826
50	NC_022118	AAT	2	6	3579	3584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532421826
51	NC_022118	TTGAA	2	10	3637	3646	40 %	40 %	20 %	0 %	532421827
52	NC_022118	ATT	2	6	3659	3664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421827
53	NC_022118	TGA	2	6	3689	3694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421827
54	NC_022118	TTTA	2	8	3812	3819	25 %	75 %	0 %	0 %	532421827
55	NC_022118	GTA	2	6	3921	3926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421827
56	NC_022118	GAGAA	2	10	3931	3940	60 %	0 %	40 %	0 %	532421827
57	NC_022118	AGA	2	6	3968	3973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421827
58	NC_022118	ATCC	2	8	4112	4119	25 %	25 %	0 %	50 %	532421827
59	NC_022118	GAA	2	6	4152	4157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421827
60	NC_022118	CGT	2	6	4284	4289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421827
61	NC_022118	A	7	7	4328	4334	100 %	0 %	0 %	0 %	532421827
62	NC_022118	GTT	2	6	4335	4340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421827
63	NC_022118	GAAAA	2	10	4368	4377	80 %	0 %	20 %	0 %	532421827
64	NC_022118	A	7	7	4374	4380	100 %	0 %	0 %	0 %	532421827
65	NC_022118	TGA	2	6	4472	4477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421827
66	NC_022118	AT	3	6	4514	4519	50 %	50 %	0 %	0 %	532421827
67	NC_022118	TTACA	2	10	4523	4532	40 %	40 %	0 %	20 %	532421827
68	NC_022118	TTG	2	6	4567	4572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421827
69	NC_022118	TTC	2	6	4708	4713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421827
70	NC_022118	TCT	2	6	4800	4805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421827
71	NC_022118	AGA	2	6	4820	4825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421827
72	NC_022118	GTT	2	6	4847	4852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421827
73	NC_022118	GACG	2	8	4859	4866	25 %	0 %	50 %	25 %	532421827
74	NC_022118	GGT	2	6	4895	4900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532421827
75	NC_022118	AAAGCT	2	12	4941	4952	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	532421827
76	NC_022118	TTGG	2	8	4962	4969	0 %	50 %	50 %	0 %	532421827
77	NC_022118	CTC	2	6	4999	5004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532421827
78	NC_022118	AGC	2	6	5030	5035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421827
79	NC_022118	ATT	2	6	5147	5152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421828
80	NC_022118	TCT	2	6	5165	5170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421828
81	NC_022118	GCT	2	6	5211	5216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421828
82	NC_022118	GTCTT	2	10	5217	5226	0 %	60 %	20 %	20 %	532421828
83	NC_022118	GAT	2	6	5246	5251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421828
84	NC_022118	TC	3	6	5262	5267	0 %	50 %	0 %	50 %	532421828
85	NC_022118	GA	3	6	5273	5278	50 %	0 %	50 %	0 %	532421828
86	NC_022118	ACG	2	6	5284	5289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421828
87	NC_022118	GAA	2	6	5308	5313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421828
88	NC_022118	TGGA	2	8	5321	5328	25 %	25 %	50 %	0 %	532421828
89	NC_022118	AT	3	6	5377	5382	50 %	50 %	0 %	0 %	532421828
90	NC_022118	AGA	3	9	5385	5393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421828
91	NC_022118	GCT	2	6	5394	5399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421828
92	NC_022118	AGA	2	6	5403	5408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421828
93	NC_022118	TGG	2	6	5439	5444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532421828
94	NC_022118	AGA	3	9	5457	5465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421828
95	NC_022118	GGA	2	6	5466	5471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421828
96	NC_022118	TG	3	6	5530	5535	0 %	50 %	50 %	0 %	532421828
97	NC_022118	T	6	6	5608	5613	0 %	100 %	0 %	0 %	532421828
98	NC_022118	TCA	2	6	5651	5656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421828
99	NC_022118	GGA	2	6	5688	5693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421828
100	NC_022118	CTTT	2	8	5698	5705	0 %	75 %	0 %	25 %	532421828
101	NC_022118	CTT	2	6	5748	5753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421828
102	NC_022118	CTG	2	6	5754	5759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421828
103	NC_022118	CAG	2	6	5909	5914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421828
104	NC_022118	AG	3	6	5938	5943	50 %	0 %	50 %	0 %	532421828
105	NC_022118	GCA	2	6	5947	5952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421828
106	NC_022118	GGGA	2	8	6213	6220	25 %	0 %	75 %	0 %	532421828
107	NC_022118	AG	3	6	6412	6417	50 %	0 %	50 %	0 %	532421829
108	NC_022118	AGG	2	6	6438	6443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421829
109	NC_022118	GAA	2	6	6482	6487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421829
110	NC_022118	GGTG	2	8	6516	6523	0 %	25 %	75 %	0 %	532421829
111	NC_022118	AAAT	2	8	6582	6589	75 %	25 %	0 %	0 %	532421829
112	NC_022118	GCA	2	6	6746	6751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421829
113	NC_022118	AAG	2	6	6787	6792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421829
114	NC_022118	TGC	2	6	6820	6825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421829
115	NC_022118	ATTT	2	8	7094	7101	25 %	75 %	0 %	0 %	532422663
116	NC_022118	TTA	2	6	7152	7157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532422663
117	NC_022118	ATTT	2	8	7185	7192	25 %	75 %	0 %	0 %	532422663
118	NC_022118	GAA	2	6	7201	7206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532422663
119	NC_022118	TCG	2	6	7314	7319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421830
120	NC_022118	TCC	2	6	7357	7362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	532421830
121	NC_022118	GTT	2	6	7465	7470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421830
122	NC_022118	AC	3	6	7647	7652	50 %	0 %	0 %	50 %	532421830
123	NC_022118	T	6	6	7683	7688	0 %	100 %	0 %	0 %	532421830
124	NC_022118	TGGTA	2	10	7690	7699	20 %	40 %	40 %	0 %	532421830
125	NC_022118	AAGC	2	8	7820	7827	50 %	0 %	25 %	25 %	532421830
126	NC_022118	TTA	2	6	7835	7840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421830
127	NC_022118	A	6	6	7967	7972	100 %	0 %	0 %	0 %	532421830
128	NC_022118	T	6	6	8052	8057	0 %	100 %	0 %	0 %	532421830
129	NC_022118	TTC	2	6	8158	8163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421830
130	NC_022118	ATTG	2	8	8218	8225	25 %	50 %	25 %	0 %	532421831
131	NC_022118	GAA	2	6	8302	8307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421831
132	NC_022118	AG	3	6	8390	8395	50 %	0 %	50 %	0 %	532421831
133	NC_022118	ACC	2	6	8430	8435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532421831
134	NC_022118	CTT	2	6	8483	8488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421831
135	NC_022118	CT	4	8	8509	8516	0 %	50 %	0 %	50 %	532421831
136	NC_022118	GAG	2	6	8563	8568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421831
137	NC_022118	ATA	2	6	8580	8585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532421831
138	NC_022118	GT	3	6	8591	8596	0 %	50 %	50 %	0 %	532421831
139	NC_022118	AGG	2	6	8604	8609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421831
140	NC_022118	AGCG	2	8	8685	8692	25 %	0 %	50 %	25 %	532421831
141	NC_022118	AAAG	2	8	8706	8713	75 %	0 %	25 %	0 %	532421831
142	NC_022118	GAA	2	6	8784	8789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421831
143	NC_022118	CAG	2	6	8800	8805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421831
144	NC_022118	A	7	7	8819	8825	100 %	0 %	0 %	0 %	532421831
145	NC_022118	TGT	2	6	8871	8876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421831
146	NC_022118	GAG	2	6	8886	8891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421831
147	NC_022118	TAC	2	6	8954	8959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421831
148	NC_022118	G	8	8	9022	9029	0 %	0 %	100 %	0 %	532421831
149	NC_022118	CTTT	2	8	9046	9053	0 %	75 %	0 %	25 %	532421831
150	NC_022118	GTT	2	6	9058	9063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421831
151	NC_022118	AAG	2	6	9082	9087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421831
152	NC_022118	CGAAA	2	10	9098	9107	60 %	0 %	20 %	20 %	532421831
153	NC_022118	GAG	2	6	9108	9113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421831
154	NC_022118	TTA	2	6	9398	9403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421832
155	NC_022118	TTCG	2	8	9420	9427	0 %	50 %	25 %	25 %	532421832
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157	NC_022118	AATT	2	8	9525	9532	50 %	50 %	0 %	0 %	532421832
158	NC_022118	A	6	6	9560	9565	100 %	0 %	0 %	0 %	532421832
159	NC_022118	T	6	6	9574	9579	0 %	100 %	0 %	0 %	532421832
160	NC_022118	ATGG	2	8	9584	9591	25 %	25 %	50 %	0 %	532421832
161	NC_022118	TGC	2	6	9663	9668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421832
162	NC_022118	GAA	2	6	9690	9695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421832
163	NC_022118	GGCTG	2	10	9734	9743	0 %	20 %	60 %	20 %	532421832
164	NC_022118	TCG	2	6	9750	9755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421832
165	NC_022118	TGG	2	6	9773	9778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532421832
166	NC_022118	GTA	2	6	9824	9829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421833
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168	NC_022118	AGC	2	6	9984	9989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421833
169	NC_022118	CTT	2	6	9998	10003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421833
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171	NC_022118	ATG	2	6	10159	10164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421833
172	NC_022118	CGT	2	6	10186	10191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421833
173	NC_022118	CTTT	2	8	10209	10216	0 %	75 %	0 %	25 %	532421833
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175	NC_022118	T	8	8	10409	10416	0 %	100 %	0 %	0 %	532421833
176	NC_022118	GCAA	2	8	10426	10433	50 %	0 %	25 %	25 %	532421833
177	NC_022118	GGT	2	6	10443	10448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532421833
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179	NC_022118	CAA	2	6	10511	10516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	532421833
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181	NC_022118	GGA	2	6	10573	10578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	532421833
182	NC_022118	T	6	6	10616	10621	0 %	100 %	0 %	0 %	532421833
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188	NC_022118	CTT	2	6	10790	10795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421833
189	NC_022118	GAAA	2	8	10799	10806	75 %	0 %	25 %	0 %	532421833
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213	NC_022118	T	6	6	11879	11884	0 %	100 %	0 %	0 %	532421834
214	NC_022118	TAC	2	6	11906	11911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421834
215	NC_022118	TCA	2	6	11913	11918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421834
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234	NC_022118	AG	3	6	12922	12927	50 %	0 %	50 %	0 %	532421835
235	NC_022118	ATGC	2	8	13004	13011	25 %	25 %	25 %	25 %	532421835
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239	NC_022118	ATA	2	6	13109	13114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	532421835
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251	NC_022118	A	8	8	13975	13982	100 %	0 %	0 %	0 %	532421836
252	NC_022118	T	7	7	13988	13994	0 %	100 %	0 %	0 %	532421836
253	NC_022118	TTGT	2	8	14040	14047	0 %	75 %	25 %	0 %	532421836
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257	NC_022118	CAG	2	6	14325	14330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421836
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259	NC_022118	AC	3	6	14407	14412	50 %	0 %	0 %	50 %	532421836
260	NC_022118	ATTT	2	8	14417	14424	25 %	75 %	0 %	0 %	532421836
261	NC_022118	A	6	6	14444	14449	100 %	0 %	0 %	0 %	532421836
262	NC_022118	CTT	2	6	14489	14494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421836
263	NC_022118	A	6	6	14651	14656	100 %	0 %	0 %	0 %	532421836
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266	NC_022118	TTA	2	6	14780	14785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421836
267	NC_022118	ATT	2	6	14855	14860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421836
268	NC_022118	TTA	2	6	14870	14875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421836
269	NC_022118	CTT	2	6	14891	14896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421836
270	NC_022118	TGT	2	6	14994	14999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421837
271	NC_022118	GATTT	2	10	15050	15059	20 %	60 %	20 %	0 %	532421837
272	NC_022118	TTTC	2	8	15079	15086	0 %	75 %	0 %	25 %	532421837
273	NC_022118	TCA	2	6	15161	15166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421837
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276	NC_022118	TAT	2	6	15467	15472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421837
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279	NC_022118	TCA	2	6	15698	15703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532421837
280	NC_022118	TTA	2	6	15706	15711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	532421837
281	NC_022118	GTA	2	6	15715	15720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532421837
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377	NC_022118	AAGAT	2	10	21443	21452	60 %	20 %	20 %	0 %	532421842
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381	NC_022118	TGGG	2	8	21647	21654	0 %	25 %	75 %	0 %	532421842
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385	NC_022118	CT	4	8	21918	21925	0 %	50 %	0 %	50 %	532421842
386	NC_022118	GAC	2	6	22030	22035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532421842
387	NC_022118	TTTGC	2	10	22054	22063	0 %	60 %	20 %	20 %	532421842
388	NC_022118	TCT	2	6	22080	22085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421842
389	NC_022118	AT	3	6	22188	22193	50 %	50 %	0 %	0 %	532421842
390	NC_022118	TTG	2	6	22274	22279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421842
391	NC_022118	TTC	2	6	22343	22348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532421842
392	NC_022118	T	6	6	22420	22425	0 %	100 %	0 %	0 %	532421842
393	NC_022118	AT	3	6	22512	22517	50 %	50 %	0 %	0 %	532421842
394	NC_022118	CTG	2	6	22523	22528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532421842
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396	NC_022118	GAA	2	6	22551	22556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421842
397	NC_022118	TTG	2	6	22605	22610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421842
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401	NC_022118	GAA	2	6	22952	22957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	532421842
402	NC_022118	TTG	2	6	22974	22979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532421842
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473	NC_022118	T	7	7	27094	27100	0 %	100 %	0 %	0 %	532421844
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